Через пользовательский интерфейс можно отключить так:
Меню Редактирование -> Установки… -> Установка обновлений: выбрать опцию «Не загружать и не устанавливать обновления автоматически»
Если отключить обновления нужно на большом количестве компов, то это можно сделать через реестр.
В разделе:
HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Policies\Adobe\Acrobat Reader\10.0\FeatureLockDown
Создаем параметр bUpdater (тип DWORD) со значением 0.
Эта настройка реестра помимо отключения автоматических обновлений еще и отключит пункт меню «Установка обновлений».
Для Adobe Reader 9 изменения в реестре — аналогичные.
Источники:
http://helpx.adobe.com/content/dam/kb/en/837/cpsid_83709/attachments/Acrobat_Reader_Updater.pdf
http://helpx.adobe.com/acrobat/kb/enterprise-administration-acrobat-products.html